
先将所有基因的FoldChange排序,对于一个给定的KEGG通路,用GSEA分析(R语言clusterProfiler包)研究该通路的基因是否显著集中于排序的某一端(即多数表达量低,或表达量高)。该分析考虑所有基因,而不仅是差异表达基因,主要是考虑到多个小效应可能协同作用于某个KEGG通路。
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A [此处写分析名称] was completed using the Wekemo Bioincloud (https:// www.bioincloud.tech) [Ref].
请引用文献:[Ref]. Yunyun Gao, Guoxing Zhang, Shunyao Jiang, Yong-Xin Liu. 2024. Wekemo Bioincloud: A user-friendly platform for meta-omics data analyses. iMeta 3: e175. https://doi.org/10.1002/imt2.175
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