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WGCNA分析
加权基因共表达网络分析 (WGCNA)是用来描述不同样品之间基因关联模式的系统生物学方法,可以用来鉴定高度协同变化的基因集, 并根据基因集的内连性和基因集与表型之间的关联鉴定候补生物标记基因或治疗靶点。相比于只关注差异表达的基因,WGCNA利用全部基因的信息识别感兴趣的基因集,并与表型进行显著性关联分析。
基因表达原始序列数矩阵:
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制表符分隔的文本文件表格;基因表达原始序列数矩阵应为正整数,基因名必须为ENSEMBL编号,表达量为fpkm
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[Ref]. Yunyun Gao, Guoxing Zhang, Shunyao Jiang, Yong-Xin Liu. 2024. Wekemo Bioincloud: A user-friendly platform for meta-omics data analyses. iMeta 3: e175. https://doi.org/10.1002/imt2.175
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