
先将所有基因的FoldChange从低到高排序,对于GSEA网站给出的Hallmark基因集研究基因集的基因是否显著集中于排序的某一端(即通路是否显著富集于上调或下调的基因)适用于对照组-实验组的实验设计。该分析考虑所有基因,而不仅是显著差异表达基因,主要适用于多个小效应可能协同作用于某个Hallmark条目。
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A [此处写分析名称] was completed using the Wekemo Bioincloud (https:// www.bioincloud.tech) [Ref].
请引用文献:[Ref]. Yunyun Gao, Guoxing Zhang, Shunyao Jiang, Yong-Xin Liu. 2024. Wekemo Bioincloud: A user-friendly platform for meta-omics data analyses. iMeta 3: e175. https://doi.org/10.1002/imt2.175
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