该文件夹下的文件为SNP和Indel分析结果,每个文件夹包含每个样本对应的结果。 bowtie2.sorted.add.markdup.vcf GATK Haplotype变异召回结果文件 bowtie2.sorted.add.markdup.snp.vcf.gz 从变异召回文件中筛选出的SNP变异 bowtie2.sorted.add.markdup.snp.filtered.vcf.gz 对SNP变异进行筛选后的文件 bowtie2.sorted.add.markdup.snp.filtered.PASS.vcf 筛选文件中为PASS的SNP变异 bowtie2.sorted.add.markdup.indel.vcf.gz 从变异召回文件中筛选出的Indel变异 bowtie2.sorted.add.markdup.indel.filtered.vcf.gz 对Indel变异进行筛选后的文件 bowtie2.sorted.add.markdup.indel.filtered.PASS.vcf 筛选文件中为PASS的Indel变异