一：文件夹结构与内容解释：
2.Differential_expression/
  ├── [分组方案]_[处理组].vs.[对照组]
  │   ├── [分组方案]_[处理组].vs.[对照组]_All_KEGG.xls    [KEGG基因差异分析的完整结果，用于下游KEGG GSEA分析]
  │   ├── [分组方案]_[处理组].vs.[对照组]_All.xls         [基因差异分析的完整结果，用于下游GO GSEA分析]
  │   ├── [分组方案]_[处理组].vs.[对照组]_DEG_KEGG.xls    [显著差异的KEGG基因集，用于下游KEGG ORA分析]
  │   ├── [分组方案]_[处理组].vs.[对照组]_DEG_STRING.xls  [显著差异的STRING基因集，用于下游PPI(蛋白互作网络)分析]
  │   ├── [分组方案]_[处理组].vs.[对照组]_DEG.xls         [显著差异的基因集，用于下游GO ORA分析，Venn|upset图，聚类热图]
  │   ├── [分组方案]_[处理组].vs.[对照组]_Volcano.svg     [差异分析火山图]
  │   ├── heatmap.svg                                   [差异最显著的基因表达量聚类热图]
  │   ├── input.xls                                     [聚类热图输入表达量矩阵]
  │   └── table.xls                                     [聚类热图最终数据]
  └── VennUpSet
      ├──venn1                                               [某两个分组如：category1和category2，在venn图中会显示具体分组]
            ├── DEG_upset.svg                                [各差异基因集之间的UpSet图]
            ├── DEG_upset_venn_intersects.xls                [各差异基因集之间的交集]
            ├── DEG_venn.svg                                 [各差异基因集之间的Venn图]
            ├── summary_up_down.svg                          [各差异基因集上调，下调数目汇总柱形图]
            ├── union_genes.xls                              [各差异基因集之间的并集]
            └── summary_up_down.xls                          [各差异基因集上调，下调数目汇总表]

二、分析参数默认值：
1、 p值阈值: 0.05
2、 Log2FoldChange阈值
3、 venn图组合：所有Category差异分析结果两两组合