从蛋白序列功能数据库注释结果中,提取属于分泌系统相关蛋白的结果。
如无特殊说明,以下内容中的“*”代表目标物种的样品名。
TNSS/ ├── *.tnss.reslut.txt 【结果文件】 └── *.tnss.sum.txt 【tnss汇总结果】
制表符分割的文本文档,使用 excel 打开。 文件内容举例如下:
文件内容说明如下:
| 列数 | 说明 |
|---|---|
| 1 | 目标物种的氨基酸序列的 ID,编号的有效字符有[a-zA-Z0-9.:^x!+_?-] |
| 2 | 数据库序列的 ID |
| 3 | 目标物种的氨基酸序列与数据库序列比对的 Identity 值 |
| 4 | 目标物种的氨基酸序列与数据库序列比对的长度 |
| 5 | 目标物种的氨基酸序列与数据库序列比对区域的比对错配数 |
| 6 | 目标物种的氨基酸序列与数据库序列比对区域的比对空位数。 |
| 7 | 目标物种的氨基酸序列的比对起始坐标 |
| 8 | 目标物种的氨基酸序列的比对终止坐标 |
| 9 | 数据库序列的比对起始坐标 |
| 10 | 数据库序列的比对终止坐标 |
| 11 | 目标物种的氨基酸序列与数据库序列比对的期望值 |
| 12 | 目标物种的氨基酸序列与数据库序列比对的比对得分 |
| 13 | 对应TNSS描述 |
| 14 | TNSS类型 |
注:此结果可能为空。
根据*.tnss.reslut.txt 最后一列TNSS类型归类汇总。
制表符分割的文本文档,使用 excel 打开。 文件内容举例如下:
文件内容说明如下:
| 行数 | 说明 |
|---|---|
| 1 | 分泌系统相关蛋白类型。 |
| 2 | 对应类型的总基因个数 |