TNSS 注释结果说明

结果简介

从蛋白序列功能数据库注释结果中,提取属于分泌系统相关蛋白的结果。

如无特殊说明,以下内容中的“*”代表目标物种的样品名。

目录结构

TNSS/ ├── *.tnss.reslut.txt 【结果文件】 └── *.tnss.sum.txt 【tnss汇总结果】

格式说明

*.tnss.reslut.txt -结果文件

制表符分割的文本文档,使用 excel 打开。 文件内容举例如下:

image-20230413170201399

文件内容说明如下:

列数说明
1目标物种的氨基酸序列的 ID,编号的有效字符有[a-zA-Z0-9.:^x!+_?-]
2数据库序列的 ID
3目标物种的氨基酸序列与数据库序列比对的 Identity 值
4目标物种的氨基酸序列与数据库序列比对的长度
5目标物种的氨基酸序列与数据库序列比对区域的比对错配数
6目标物种的氨基酸序列与数据库序列比对区域的比对空位数。
7目标物种的氨基酸序列的比对起始坐标
8目标物种的氨基酸序列的比对终止坐标
9数据库序列的比对起始坐标
10数据库序列的比对终止坐标
11目标物种的氨基酸序列与数据库序列比对的期望值
12目标物种的氨基酸序列与数据库序列比对的比对得分
13对应TNSS描述
14TNSS类型

注:此结果可能为空。

*.tnss.sum.txt -tnss汇总结果

根据*.tnss.reslut.txt 最后一列TNSS类型归类汇总。

制表符分割的文本文档,使用 excel 打开。 文件内容举例如下:

image-20230413170542949

文件内容说明如下:

行数说明
1分泌系统相关蛋白类型。
2对应类型的总基因个数

 

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